Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tubg1P83887 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubg1P83887 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubg1P83887 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms