Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabpb2P81069 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabpb2P81069 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabpb2P81069 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms