Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ErfP70459 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ErfP70459 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ErfP70459 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ErfP70459 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ErfP70459 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ErfP70459 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ErfP70459 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ErfP70459 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ErfP70459 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ErfP70459 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ErfP70459 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms