Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Stra8P70278 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Stra8P70278 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stra8P70278 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Stra8P70278 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Stra8P70278 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms