Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Traf6P70196 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Traf6P70196 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Traf6P70196 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms