Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb4bP68372 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4bP68372 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb4bP68372 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms