Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps4xP62702 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps4xP62702 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms