Protein–RNA interactions for Protein: P62334

Psmc6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc6P62334 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmc6P62334 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmc6P62334 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmc6P62334 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms