Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpd3P62320 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrpd3P62320 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrpd3P62320 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms