Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rims4P60191 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rims4P60191 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms