Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nphp4P59240 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nphp4P59240 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nphp4P59240 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nphp4P59240 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms