Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GemP55041 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GemP55041 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GemP55041 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GemP55041 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GemP55041 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GemP55041 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GemP55041 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GemP55041 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GemP55041 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GemP55041 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GemP55041 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GemP55041 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GemP55041 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GemP55041 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GemP55041 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms