Protein–RNA interactions for Protein: P53566

Cebpa, CCAAT/enhancer-binding protein alpha, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpaP53566 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CebpaP53566 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CebpaP53566 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpaP53566 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CebpaP53566 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms