Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Map3k1P53349 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Map3k1P53349 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Map3k1P53349 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms