Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnt2P50752 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnt2P50752 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnt2P50752 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms