Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpl13P47963 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpl13P47963 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpl13P47963 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms