Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pax7P47239 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax7P47239 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax7P47239 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax7P47239 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax7P47239 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms