Protein–RNA interactions for Protein: P46735

Myo1b, Unconventional myosin-Ib, mousemouse

Predictions only

Length 1,107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1bP46735 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1bP46735 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Myo1bP46735 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Myo1bP46735 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms