Protein–RNA interactions for Protein: P43352

Rad52, DNA repair protein RAD52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad52P43352 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rad52P43352 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rad52P43352 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rad52P43352 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms