Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Clec3bP43025 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Clec3bP43025 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms