Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vcam1P29533 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vcam1P29533 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vcam1P29533 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms