Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col2a1P28481 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col2a1P28481 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col2a1P28481 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms