Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
U2af2P26369 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
U2af2P26369 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
U2af2P26369 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af2P26369 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
U2af2P26369 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms