Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Itgb7P26011 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb7P26011 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb7P26011 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms