Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax3P24610 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax3P24610 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pax3P24610 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax3P24610 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax3P24610 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax3P24610 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pax3P24610 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax3P24610 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms