Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn1P22387 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn1P22387 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn1P22387 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Edn1P22387 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms