Protein–RNA interactions for Protein: P21126

Ubl4a, Ubiquitin-like protein 4A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4aP21126 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubl4aP21126 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubl4aP21126 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl4aP21126 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl4aP21126 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl4aP21126 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ubl4aP21126 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms