Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lsp1P19973 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lsp1P19973 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lsp1P19973 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms