Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P18529 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18529 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P18529 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P18529 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P18529 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
P18529 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
P18529 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P18529 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P18529 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P18529 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P18529 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P18529 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P18529 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms