Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgfr1P16092 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgfr1P16092 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fgfr1P16092 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fgfr1P16092 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fgfr1P16092 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms