Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RaraP11416 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaraP11416 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RaraP11416 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RaraP11416 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaraP11416 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaraP11416 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaraP11416 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RaraP11416 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RaraP11416 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RaraP11416 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RaraP11416 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RaraP11416 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RaraP11416 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RaraP11416 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RaraP11416 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RaraP11416 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RaraP11416 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RaraP11416 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RaraP11416 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RaraP11416 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms