Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PolP11369 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PolP11369 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PolP11369 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PolP11369 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PolP11369 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PolP11369 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PolP11369 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PolP11369 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PolP11369 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PolP11369 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PolP11369 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PolP11369 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms