Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Col1a1P11087 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Col1a1P11087 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col1a1P11087 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms