Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtsbP10605 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsbP10605 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CtsbP10605 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsbP10605 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtsbP10605 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms