Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nid1P10493 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nid1P10493 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms