Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Schip1P0DPB4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Schip1P0DPB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Schip1P0DPB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms