Protein–RNA interactions for Protein: P08923

Ltk, Leukocyte tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtkP08923 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LtkP08923 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LtkP08923 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtkP08923 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LtkP08923 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LtkP08923 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LtkP08923 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LtkP08923 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LtkP08923 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LtkP08923 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LtkP08923 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LtkP08923 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtkP08923 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LtkP08923 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtkP08923 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LtkP08923 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LtkP08923 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LtkP08923 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LtkP08923 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtkP08923 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtkP08923 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtkP08923 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LtkP08923 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LtkP08923 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtkP08923 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtkP08923 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtkP08923 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtkP08923 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LtkP08923 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LtkP08923 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LtkP08923 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtkP08923 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LtkP08923 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LtkP08923 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms