Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna4P07351 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna4P07351 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms