Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ifna5P07349 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ifna5P07349 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms