Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P04942 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P04942 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P04942 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P04942 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P04942 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P04942 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P04942 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P04942 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04942 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P04942 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P04942 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P04942 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms