Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01741 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01741 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01741 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01741 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01741 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01741 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01741 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01741 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01741 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms