Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hcn2O88703 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hcn2O88703 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms