Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pak1O88643 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pak1O88643 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1O88643 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pak1O88643 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pak1O88643 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms