Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc6a20bO88575 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a20bO88575 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a20bO88575 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a20bO88575 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a20bO88575 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms