Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IkbkbO88351 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IkbkbO88351 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms