Protein–RNA interactions for Protein: O70576

Stag3, Cohesin subunit SA-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag3O70576 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Stag3O70576 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Stag3O70576 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Stag3O70576 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag3O70576 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag3O70576 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Stag3O70576 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stag3O70576 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Stag3O70576 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms