Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Xirp1O70373 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Xirp1O70373 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Xirp1O70373 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms