Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtssO70370 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CtssO70370 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CtssO70370 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CtssO70370 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CtssO70370 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CtssO70370 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CtssO70370 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CtssO70370 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtssO70370 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtssO70370 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtssO70370 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtssO70370 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms