Protein–RNA interactions for Protein: O55131

Sept7, Septin-7, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept7O55131 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept7O55131 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sept7O55131 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept7O55131 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept7O55131 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sept7O55131 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept7O55131 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sept7O55131 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Sept7O55131 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sept7O55131 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sept7O55131 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sept7O55131 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sept7O55131 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept7O55131 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sept7O55131 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sept7O55131 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept7O55131 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sept7O55131 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept7O55131 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept7O55131 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sept7O55131 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sept7O55131 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms