Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3O55013 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Trappc3O55013 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc3O55013 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms